Бывают ситуации когда микроконтроллер то ли из-за программ или неправильных ошибочных действий при программировании блокируется и отказывается программироваться повторно в ISP-режиме.
Исторически сложилось так, что даже самые первые модели микроконтроллеров имели программируемые ячейки защиты информации. Микроконтроллеры AVR так же имеют такую защиту.